Sériová výroba vozidla byla zahájena v květnu 1945. 7. září 1945 se tanky typu IS-3 zúčastnily spojenecké vítězné přehlídky v Berlíně. Celkem bylo do konce roku 1946 vyrobeno 1 170 vozidel a poté byla výroba zrušena. Od roku 1948 do pozdních 50. let prošly tanky řadou modernizací výstroje.